Ngày 20/3/2012, Apple bác bỏ tất cả những lo ngại về việc iPad mới quá nóng khi hoạt động. Apple nói rằng, sản phẩm hoạt động tốt trong phạm vi các tiêu chuẩn về nhiệt độ cho phép. Theo một đại diện của Apple, người dùng nên liên hệ với bộ phận hỗ trợ khách hàng nếu thiết bị của họ có vấn đề.
Khi tháo dây sạc, nhiệt độ của máy tính bảng giảm chút xíu, còn 45 độ C. Consumer Reports cũng thấy rằng, pin iPad không sạc khi game đang chạy.
Apple chưa có bình luận gì về các thử nghiệm do Consumer Reports tiến hành. Hồi năm 2010, chính Consumer Reports đã phơi bày các vấn đề về lỗi ăng-ten trong iPhone 4.
Giống như iPad 2, máy tính bảng mới của Apple có phạm vi nhiệt độ hoạt động cho phép từ 0 - 35 độ C. Bộ xử lý A5X có nhiều hơn 2 lõi đồ họa so với “tiền bối” A5 của nó. Theo kết quả “mổ máy” của iFixit, iPad mới có pin 42,5Wh, lớn hơn so với pin 25Wh trong iPad 2.
Đã nhiều lần pin là nguyên nhân gây nóng trong các MTXT. Trong quá khứ, Lenovo, Hewlett-Packard, Dell, Sony và Toshiba đã thu hồi nhiều gói pin lithium-ion vì chúng quá nóng, gây cháy. Apple cũng từng phải thay thế pin cho một số chiếc iPad Nano thế hệ đầu tiên được bán từ tháng 9/2005 - 12/2006 do chúng quá nóng.